All the SSRs can be select and download (CSV, EXCEL,...) with the primers pairs
Choose button view to access to the primers and the flanking sequences or e-PCR to search transferability of the selected marker
| MarkerID | Sequence Name | Motif | Fp | Rp | psize | start | end | Fta | Rta | Reps | Size | Flanking | Code | View/ePCR | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| YMa168939 | LG16 | (AT)20 | CACACACACACACACACACA | CGTGCCAAATATCGTGCCAA | 238 | 19456175 | 19456214 | 59.129 | 59.55 | 20 | 238 | GACAAATAAATTCATTGCTATATTTTTTATTATCTTCCTAAAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATAGACACACACACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTGTAGGTAGGTATGTATGTATATAGTACACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTACATACGTATATTATAGATATACTATATCTATAAACACACATATTGTATAATTCCAATTTTAATTAATTTTTTACTAAATAATAACAAGCTATTATATTTGGCACGATATTTGGCACGGTTGTTTCCAAACTGTGACAAA | 10 | ||
| YMa168939 | LG16 | (AT)20 | CACACACACACACACACACA | CGTGCCAAATATCGTGCCAA | 238 | 19456175 | 19456214 | 59.129 | 59.55 | 20 | 238 | GACAAATAAATTCATTGCTATATTTTTTATTATCTTCCTAAAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATAGACACACACACACACACACACACACACACACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCTGTAGGTAGGTATGTATGTATATAGTACACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTACATACGTATATTATAGATATACTATATCTATAAACACACATATTGTATAATTCCAATTTTAATTAATTTTTTACTAAATAATAACAAGCTATTATATTTGGCACGATATTTGGCACGGTTGTTTCCAAACTGTGACAAA | 12 |