All the SSRs can be select and download (CSV, EXCEL,...) with the primers pairs
Choose button view to access to the primers and the flanking sequences or e-PCR to search transferability of the selected marker
| MarkerID | Sequence Name | Motif | Fp | Rp | psize | start | end | Fta | Rta | Reps | Size | Flanking | Code | View/ePCR | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| YMa198715 | LG19 | (CA)7 | ACACCTGATCTTAGTGCAAAGT | AGCTGTGGTCCTCCTATATTCCT | 264 | 2061769 | 2061782 | 57.642 | 60.117 | 7 | 264 | AGCAAAGTACACAAACTATACAATAATTATAGCTCATAACAATTCACTATGGTCACTGTATTTCAAATAAACACCTGATCTTAGTGCAAAGTACAATACACTAAAAAACTATGGATTTACACACACTAATACAAGATCTGCACTTTCAAAATTTTCCAAGTAATAAATTGAATTCATTGATGATTAACATGATAAAAAACACACACACACACATTATTTTTAAAAAATAATAAGTAAAGTCTAAACCCATCAATAATTTAAACTCAAATCACAAGCAAGCTCAATTAATTAATAGCATCATATAGGAAATTAGGAATATAGGAGGACCACAGCTTTTAAAGCGTGGAGGATTACAATAATAATTATTATTTAATTCACAAGCTTCGAATCTAAGTCAAGCAGATGCCTGCCACG | 10 | ||
| YMa198715 | LG19 | (CA)7 | ACACCTGATCTTAGTGCAAAGT | AGCTGTGGTCCTCCTATATTCCT | 264 | 2061769 | 2061782 | 57.642 | 60.117 | 7 | 264 | AGCAAAGTACACAAACTATACAATAATTATAGCTCATAACAATTCACTATGGTCACTGTATTTCAAATAAACACCTGATCTTAGTGCAAAGTACAATACACTAAAAAACTATGGATTTACACACACTAATACAAGATCTGCACTTTCAAAATTTTCCAAGTAATAAATTGAATTCATTGATGATTAACATGATAAAAAACACACACACACACATTATTTTTAAAAAATAATAAGTAAAGTCTAAACCCATCAATAATTTAAACTCAAATCACAAGCAAGCTCAATTAATTAATAGCATCATATAGGAAATTAGGAATATAGGAGGACCACAGCTTTTAAAGCGTGGAGGATTACAATAATAATTATTATTTAATTCACAAGCTTCGAATCTAAGTCAAGCAGATGCCTGCCACG | 12 |